Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms