Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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