Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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IFT88Q13099 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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IFT88Q13099 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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