Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACACAQ13085 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACACAQ13085 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms