Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRJQ12913 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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