Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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GRIN2AQ12879 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN2AQ12879 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
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