Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms