Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C2orf54Q08AI8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms