Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SSRP1Q08945 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms