Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TNP2Q05952 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms