Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms