Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NUCB1Q02818 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUCB1Q02818 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms