Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms