Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLTCQ00610 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms