Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms