Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms