Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL23P62829 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL23P62829 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms