Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVS71-1P61550 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms