Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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TMEM258P61165 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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