Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXG1P55316 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXG1P55316 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXG1P55316 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXG1P55316 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXG1P55316 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXG1P55316 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXG1P55316 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms