Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms