Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATXN3P54252 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATXN3P54252 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATXN3P54252 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms