Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms