Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DAP3P51398 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DAP3P51398 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms