Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP153P49790 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP153P49790 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP153P49790 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUP153P49790 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP153P49790 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms