Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms