Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTGER3P43115 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms