Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK1P39086 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK1P39086 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms