Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms