Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT4P35916 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT4P35916 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT4P35916 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FLT4P35916 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
FLT4P35916 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FLT4P35916 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FLT4P35916 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
FLT4P35916 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT4P35916 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FLT4P35916 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FLT4P35916 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms