Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NTF4P34130 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NTF4P34130 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NTF4P34130 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms