Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms