Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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HOXD10P28358 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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HOXD10P28358 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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HOXD10P28358 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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HOXD10P28358 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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HOXD10P28358 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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HOXD10P28358 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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HOXD10P28358 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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HOXD10P28358 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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HOXD10P28358 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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