Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHATP28329 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHATP28329 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHATP28329 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms