Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXP28300 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXP28300 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXP28300 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms