Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms