Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms