Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PLNP26678 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms