Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMA4P25789 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms