Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSSP25774 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSSP25774 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSSP25774 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSSP25774 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms