Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LHCGRP22888 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHCGRP22888 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms