Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USF1P22415 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USF1P22415 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF1P22415 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF1P22415 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF1P22415 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF1P22415 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF1P22415 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF1P22415 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF1P22415 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF1P22415 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF1P22415 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USF1P22415 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF1P22415 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms