Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB1P20618 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms