Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BMP4P12644 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMP4P12644 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BMP4P12644 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms