Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms