Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLUP10909 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLUP10909 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLUP10909 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLUP10909 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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