Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms