Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms