Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC2P0DI81 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC2P0DI81 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms