Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSP90AB1P08238 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms